Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BORCS6Q96GS4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms