Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms