Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms