Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF4BQ92750 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms