Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms