Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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