Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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