Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX32Q86XE0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms