Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIBP1Q86W92 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms