Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms