Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms