Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD1Q5SYB0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms