Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP170Q5SW79 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms