Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms