Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms