Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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