Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms