Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms