Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PCSK7Q16549 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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