Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXT1Q16394 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms