Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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E2F4Q16254 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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E2F4Q16254 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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E2F4Q16254 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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E2F4Q16254 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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E2F4Q16254 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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