Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
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SCN9AQ15858 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SCN9AQ15858 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SCN9AQ15858 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN9AQ15858 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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