Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms