Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNHIT3Q15649 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms