Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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