Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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