Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 948.2 ms