Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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