Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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