Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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