Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGRF1Q13972 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms