Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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