Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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