Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PEX6Q13608 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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