Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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