Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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