Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MKRN3Q13064 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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MKRN3Q13064 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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MKRN3Q13064 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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