Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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