Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms