Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms