Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXC1Q12948 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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