Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms