Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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