Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SYCNQ0VAF6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SYCNQ0VAF6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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SYCNQ0VAF6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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