Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms