Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms