Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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