Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LTBQ06643 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTBQ06643 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTBQ06643 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LTBQ06643 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LTBQ06643 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms