Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AP001171.1-201ENST00000436373 864 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms