Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHRNEQ04844 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHRNEQ04844 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHRNEQ04844 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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